Misją Politechniki Krakowskiej, jako państwowej, publicznej, autonomicznej uczelni akademickiej jest szerzenie wiedzy opartej o badania naukowe prowadzone przez jej pracowników.
Zachowując tradycje akademickie i sprawdzone struktury organizacyjne, badania naukowe - i wynikająca stąd dydaktyka - powinny się koncentrować na wybranych kierunkach, znaczących zarówno z punktu widzenia poznawczego w skali światowej jak i dla gospodarki Kraju. U progu pierwszego 10-lecia XXI wieku za takie kierunki, możliwe do podjęcia w Politechnice Krakowskiej uznaje się: ochronę środowiska, energetykę, komunikację i technologie informacyjne. Kierunki te powinny przenikać działalność wszystkich wydziałów i sprzyjać tworzeniu - w razie potrzeby - nowych instytucji w ramach Uczelni. Badania naukowe powinny być prowadzone przede wszystkim w oparciu o środki uzyskiwane z zewnątrz Uczelni (granty krajowe i międzynarodowe, współpraca z przemysłem); środki rządowe przyznawane Uczelni centralnie na badania naukowe powinny być wykorzystywane bezpośrednio dla pokrywaniakosztów rzeczowych i osobowych związanych z realizacją badań naukowych. Szczególny nacisk powinien być położony na wykorzystanie badań prowadzących do efektywnego transferu technologii pomiędzy Uczelnią a przemysłem.
Edukacja powinna mieć charakter podstawowy, umożliwiający absolwentom podejmowanie w przyszłości pracy w zawodach, które obecnie nie istniejąc, mogą się pojawić w wyniku rozwoju cywilizacyjnego. W tym kontekście, nacisk powinien być położony na rozwijanie umiejętności samokształcenia się studentów i przygotowania do uczenia się ustawicznego, z wykorzystaniem technologii informacyjnych. Równocześnie, studenci przejmując na siebie zadanie uczenia się powinni mieć zapewniony większy kontakt osobisty z nauczycielami, co może wymagać redukcji zajęć obowiązkowych i odchodzenia od tradycyjnego podziału zajęć na wykłady, ćwiczenia, projekty, laboratoria i seminaria.
Wykorzystanie wysokiego potencjału naukowego pracowników Uczelni i troska o jego dalszy wzrost powinna prowadzić do jak najwcześniejszego włączania studentów w prace badawcze, co wymaga przesunięcia punktu ciężkości nauczania z podstawowego (studia inżynierskie) na studiowanie na wyższych poziomach (studia magisterskie i doktoranckie).
Uczelnia, jako instytucja wyższej użyteczności publicznej, musi również dbać o tworzenie atmosfery sprzyjającej podnoszeniu ogólnego poziomu kulturowego, poprzez humanizację studiów i wymaganie od jej absolwentów znajomości języków obcych i języka ojczystego, a także ojczystej historii i kultury.